【摘要】目的 观察宏基因组二代测序(mNGS)在新生儿感染性疾病诊疗中的应用情况。方法 回顾性分析2020年1月—2023年12月柳州市人民医院新生儿科住院的53例诊断为感染性疾病的新生儿临床资料，收集的53份检验标本(20份血液标本，11份脑脊液标本，22份呼吸道分泌物标本)分别进行传统微生物培养及mNGS检测。观察不同标本的培养结果，比较传统微生物培养法和mGS对不同标本的病原体检出情况；观察根据病原学检查结果调整抗菌药应用情况。结果 53份检验标本中，传统微生物培养法病原体检测阳性13例(24.5%)，mNGS病原体检测阳性37例(69.8%)，mNGS病原体检测阳性率高于传统微生物培养法(P＜0.05)。mNGS对不同标本的检测结果提示，血液病原体检测阳性9例(45.0%)，脑脊液病原体检测阳性8例(72.7%)，呼吸道分泌物病原体检测阳性20例(90.9%)，差异有统计学意义(P＜0.05)。在mNGS检测结果指导下，41例患儿调整治疗方案，其中，10例患儿停用抗菌药，17例患儿升级抗菌药，2例患儿降级抗菌药，10例患儿加用其他抗菌药治疗，2例患儿更换抗菌药。结论 mNGS较传统微生物培养法有更高的病原体检测阳性率，mNGS结果对指导临床抗菌药治疗具有重要作用。

【关键词】新生儿；感染性疾病；高通量测序；宏基因组；二代测序；抗菌药